Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA3P32297 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms