Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM247A6NEH6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms