Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HMX2A2RU54 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMX2A2RU54 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMX2A2RU54 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMX2A2RU54 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMX2A2RU54 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMX2A2RU54 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMX2A2RU54 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMX2A2RU54 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMX2A2RU54 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HMX2A2RU54 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMX2A2RU54 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMX2A2RU54 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HMX2A2RU54 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HMX2A2RU54 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMX2A2RU54 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMX2A2RU54 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMX2A2RU54 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMX2A2RU54 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMX2A2RU54 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMX2A2RU54 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMX2A2RU54 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMX2A2RU54 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMX2A2RU54 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMX2A2RU54 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMX2A2RU54 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMX2A2RU54 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMX2A2RU54 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMX2A2RU54 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMX2A2RU54 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMX2A2RU54 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMX2A2RU54 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMX2A2RU54 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMX2A2RU54 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HMX2A2RU54 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMX2A2RU54 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMX2A2RU54 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms