Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 436 ms