Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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NCOA1Q15788 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
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NCOA1Q15788 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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NCOA1Q15788 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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NCOA1Q15788 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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NCOA1Q15788 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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NCOA1Q15788 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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NCOA1Q15788 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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