Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms