Protein–RNA interactions for Protein: P46093

GPR4, G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR4P46093 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GPR4P46093 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GPR4P46093 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
GPR4P46093 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GPR4P46093 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GPR4P46093 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GPR4P46093 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GPR4P46093 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GPR4P46093 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
GPR4P46093 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
GPR4P46093 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
GPR4P46093 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
GPR4P46093 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
GPR4P46093 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GPR4P46093 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GPR4P46093 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GPR4P46093 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GPR4P46093 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GPR4P46093 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GPR4P46093 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GPR4P46093 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
GPR4P46093 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GPR4P46093 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GPR4P46093 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GPR4P46093 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GPR4P46093 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GPR4P46093 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GPR4P46093 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GPR4P46093 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GPR4P46093 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GPR4P46093 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GPR4P46093 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GPR4P46093 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GPR4P46093 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GPR4P46093 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GPR4P46093 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GPR4P46093 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GPR4P46093 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GPR4P46093 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GPR4P46093 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GPR4P46093 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GPR4P46093 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GPR4P46093 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GPR4P46093 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms