Protein–RNA interactions for Protein: P30520

ADSS, Adenylosuccinate synthetase isozyme 2, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADSSP30520 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ADSSP30520 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ADSSP30520 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ADSSP30520 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ADSSP30520 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ADSSP30520 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ADSSP30520 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ADSSP30520 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
ADSSP30520 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ADSSP30520 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ADSSP30520 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ADSSP30520 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ADSSP30520 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ADSSP30520 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ADSSP30520 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ADSSP30520 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ADSSP30520 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ADSSP30520 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ADSSP30520 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ADSSP30520 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ADSSP30520 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ADSSP30520 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ADSSP30520 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ADSSP30520 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ADSSP30520 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ADSSP30520 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ADSSP30520 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ADSSP30520 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ADSSP30520 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ADSSP30520 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ADSSP30520 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ADSSP30520 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ADSSP30520 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ADSSP30520 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ADSSP30520 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ADSSP30520 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ADSSP30520 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ADSSP30520 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ADSSP30520 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ADSSP30520 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ADSSP30520 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ADSSP30520 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ADSSP30520 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ADSSP30520 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ADSSP30520 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ADSSP30520 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ADSSP30520 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ADSSP30520 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ADSSP30520 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ADSSP30520 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms