Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms