Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms