Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms