Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5DP30049 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5DP30049 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5DP30049 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5DP30049 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5DP30049 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5DP30049 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5DP30049 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5DP30049 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5DP30049 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5DP30049 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5DP30049 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5DP30049 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5DP30049 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5DP30049 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5DP30049 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5DP30049 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5DP30049 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5DP30049 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5DP30049 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5DP30049 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5DP30049 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5DP30049 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5DP30049 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms