Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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PFDN4Q9NQP4 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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PFDN4Q9NQP4 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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PFDN4Q9NQP4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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PFDN4Q9NQP4 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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PFDN4Q9NQP4 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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PFDN4Q9NQP4 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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PFDN4Q9NQP4 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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