Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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