Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL38Q2WGJ6 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms