Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms