Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP36Q9P275 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP36Q9P275 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms