Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms