Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms