Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BBOF1Q8ND07 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms