Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RASGRF1Q13972 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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