Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms