Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P62684 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms