Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMA5P28066 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms