Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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USP43Q70EL4 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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USP43Q70EL4 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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USP43Q70EL4 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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USP43Q70EL4 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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USP43Q70EL4 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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USP43Q70EL4 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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