Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms