Protein–RNA interactions for Protein: Q15527

SURF2, Surfeit locus protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF2Q15527 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SURF2Q15527 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms