Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

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Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
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