Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXC5Q00444 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms