Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFSF9P41273 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms