Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINB3P29508 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINB3P29508 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINB3P29508 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINB3P29508 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINB3P29508 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINB3P29508 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINB3P29508 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINB3P29508 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINB3P29508 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINB3P29508 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINB3P29508 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINB3P29508 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINB3P29508 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINB3P29508 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINB3P29508 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINB3P29508 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINB3P29508 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINB3P29508 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINB3P29508 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINB3P29508 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINB3P29508 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINB3P29508 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINB3P29508 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINB3P29508 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SERPINB3P29508 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINB3P29508 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SERPINB3P29508 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINB3P29508 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINB3P29508 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINB3P29508 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINB3P29508 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINB3P29508 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINB3P29508 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINB3P29508 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINB3P29508 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINB3P29508 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINB3P29508 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINB3P29508 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINB3P29508 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINB3P29508 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SERPINB3P29508 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINB3P29508 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINB3P29508 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINB3P29508 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SERPINB3P29508 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SERPINB3P29508 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SERPINB3P29508 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SERPINB3P29508 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SERPINB3P29508 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms