Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms