Protein–RNA interactions for Protein: O14558

HSPB6, Heat shock protein beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB6O14558 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSPB6O14558 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms