Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms