Protein–RNA interactions for Protein: Q15835

GRK1, Rhodopsin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRK1Q15835 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
GRK1Q15835 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
GRK1Q15835 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GRK1Q15835 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GRK1Q15835 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GRK1Q15835 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GRK1Q15835 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GRK1Q15835 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GRK1Q15835 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
GRK1Q15835 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GRK1Q15835 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GRK1Q15835 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GRK1Q15835 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GRK1Q15835 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GRK1Q15835 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GRK1Q15835 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GRK1Q15835 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GRK1Q15835 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GRK1Q15835 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GRK1Q15835 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GRK1Q15835 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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