Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms