Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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CLDN25C9JDP6 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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CLDN25C9JDP6 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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CLDN25C9JDP6 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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CLDN25C9JDP6 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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CLDN25C9JDP6 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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CLDN25C9JDP6 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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CLDN25C9JDP6 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN25C9JDP6 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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