Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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C4orf47A7E2U8 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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C4orf47A7E2U8 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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C4orf47A7E2U8 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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C4orf47A7E2U8 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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C4orf47A7E2U8 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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C4orf47A7E2U8 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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C4orf47A7E2U8 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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C4orf47A7E2U8 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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