Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PACSIN1Q9BY11 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PACSIN1Q9BY11 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms