Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms