Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GCAP28676 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GCAP28676 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
GCAP28676 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GCAP28676 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GCAP28676 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GCAP28676 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCAP28676 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GCAP28676 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GCAP28676 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GCAP28676 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GCAP28676 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GCAP28676 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCAP28676 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCAP28676 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCAP28676 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GCAP28676 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCAP28676 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCAP28676 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GCAP28676 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GCAP28676 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GCAP28676 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCAP28676 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GCAP28676 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCAP28676 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GCAP28676 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GCAP28676 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GCAP28676 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GCAP28676 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
GCAP28676 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GCAP28676 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GCAP28676 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GCAP28676 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GCAP28676 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GCAP28676 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GCAP28676 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GCAP28676 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GCAP28676 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GCAP28676 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GCAP28676 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GCAP28676 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GCAP28676 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GCAP28676 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GCAP28676 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GCAP28676 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GCAP28676 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GCAP28676 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GCAP28676 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GCAP28676 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GCAP28676 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GCAP28676 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GCAP28676 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GCAP28676 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GCAP28676 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GCAP28676 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GCAP28676 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GCAP28676 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GCAP28676 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GCAP28676 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GCAP28676 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GCAP28676 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GCAP28676 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GCAP28676 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GCAP28676 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
GCAP28676 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GCAP28676 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GCAP28676 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GCAP28676 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GCAP28676 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GCAP28676 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GCAP28676 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GCAP28676 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GCAP28676 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCAP28676 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCAP28676 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCAP28676 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCAP28676 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCAP28676 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCAP28676 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCAP28676 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCAP28676 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCAP28676 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
GCAP28676 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCAP28676 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCAP28676 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCAP28676 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCAP28676 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCAP28676 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCAP28676 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCAP28676 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
GCAP28676 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCAP28676 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
GCAP28676 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCAP28676 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCAP28676 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCAP28676 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCAP28676 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCAP28676 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCAP28676 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCAP28676 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms