Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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CXCL2P19875 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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CXCL2P19875 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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CXCL2P19875 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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CXCL2P19875 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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CXCL2P19875 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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CXCL2P19875 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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CXCL2P19875 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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CXCL2P19875 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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CXCL2P19875 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CXCL2P19875 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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