Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAPLNO95428 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms