Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 DRC7-202ENST00000360716 3041 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 ACSF3-201ENST00000317447 3664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 MAP7-208ENST00000617204 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 PITRM1-201ENST00000224949 3450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 AL592528.1-201ENST00000380008 3466 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 CYTH1-210ENST00000589297 3756 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 C1QTNF6-201ENST00000337843 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 SARDH-207ENST00000439388 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 ACCS-201ENST00000263776 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 PNMA5-201ENST00000361887 3197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 AC105402.3-202ENST00000446781 2592 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 AL445647.1-201ENST00000606221 3599 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 DNAJB12-203ENST00000444643 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 ARMCX2-203ENST00000356824 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 PRPF6-201ENST00000266079 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 AC106865.1-201ENST00000602666 3034 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 SEC23B-201ENST00000262544 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 SMCR5-201ENST00000543475 2844 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 FUT8-204ENST00000394586 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 MARCH10-209ENST00000583600 3214 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 CPT1C-203ENST00000392518 2910 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 FERMT2-201ENST00000341590 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 AC006037.2-201ENST00000622975 2232 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 RAB6A-202ENST00000336083 3085 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 TRAPPC2L-211ENST00000565504 3102 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 PPP1R12B-214ENST00000491336 2046 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 AC135050.1-201ENST00000622229 3380 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms