Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VN1R3Q9BXE9 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms