Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C2orf48Q96LS8 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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