Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF4Q2M2E3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms