Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRX1P78414 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRX1P78414 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRX1P78414 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRX1P78414 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRX1P78414 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRX1P78414 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRX1P78414 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRX1P78414 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRX1P78414 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRX1P78414 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRX1P78414 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRX1P78414 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRX1P78414 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRX1P78414 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRX1P78414 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRX1P78414 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRX1P78414 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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IRX1P78414 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRX1P78414 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRX1P78414 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
IRX1P78414 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
IRX1P78414 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRX1P78414 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRX1P78414 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRX1P78414 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRX1P78414 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRX1P78414 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRX1P78414 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRX1P78414 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRX1P78414 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
IRX1P78414 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRX1P78414 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRX1P78414 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRX1P78414 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRX1P78414 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRX1P78414 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRX1P78414 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRX1P78414 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRX1P78414 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
IRX1P78414 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
IRX1P78414 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
IRX1P78414 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
IRX1P78414 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
IRX1P78414 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
IRX1P78414 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
IRX1P78414 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
IRX1P78414 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
IRX1P78414 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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