Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3QRK9 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
J3QRK9 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
J3QRK9 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
J3QRK9 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
J3QRK9 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
J3QRK9 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
J3QRK9 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
J3QRK9 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
J3QRK9 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3QRK9 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3QRK9 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3QRK9 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3QRK9 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3QRK9 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3QRK9 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3QRK9 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3QRK9 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3QRK9 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3QRK9 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3QRK9 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3QRK9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3QRK9 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3QRK9 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3QRK9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3QRK9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3QRK9 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3QRK9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3QRK9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
J3QRK9 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
J3QRK9 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3QRK9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3QRK9 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3QRK9 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
J3QRK9 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3QRK9 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3QRK9 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3QRK9 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3QRK9 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3QRK9 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3QRK9 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3QRK9 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3QRK9 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
J3QRK9 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3QRK9 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3QRK9 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3QRK9 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3QRK9 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3QRK9 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3QRK9 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
J3QRK9 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3QRK9 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3QRK9 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3QRK9 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3QRK9 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3QRK9 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3QRK9 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3QRK9 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
J3QRK9 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3QRK9 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3QRK9 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3QRK9 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3QRK9 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms