Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWF9

TRBV2, T-cell receptor beta variable 2 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV2A0A0J9YWF9 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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TRBV2A0A0J9YWF9 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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TRBV2A0A0J9YWF9 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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TRBV2A0A0J9YWF9 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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TRBV2A0A0J9YWF9 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV2A0A0J9YWF9 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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